乌鲁木齐市第一人民医院分院
乌鲁木齐市第一人民医院分院（原乌鲁木齐县人民医院）位于河南东路806号，占地面积27300平方米，业务用房面积12000平方米。现拥有固定资产3500万元，医疗专用设备1875万，全院职工353人，专业技术人员316人，是一所集医疗、科研、教学为一体的综合型二级甲等医院和全国爱婴医院。主要承担乌鲁木齐农、牧民医疗保健工作及乌鲁木齐县乡镇卫生院专业技术人员的培训和业务指导工作。
新疆军区总医院
新疆军区总医院前身为国民党联勤总部第60医院，新疆和平解放后，1950年1月整编建院。历经10多次编制调整，1986年定编为兰州军区乌鲁木齐总医院。2016年隶属陆军建制，改称新疆军区总医院。医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型综合性三级甲等医院，是新疆维吾尔自治区、新疆生产建设兵团以及乌鲁木齐市医疗保障制度改革定点医疗单位。
乌鲁木齐儿童医院
乌鲁木齐儿童医院（前身为乌鲁木齐市第一人民医院），成立于1934年2月，1988年经自治区卫生厅批准改建为儿童医院，1997年正式命名为乌鲁木齐儿童医院。
新疆生产建设兵团第六师医院
第六师医院创建于1953年，伴随着共和国半个多世纪的奋进历程，已经走过了六十七年的沧桑岁月，已发展成为集医疗、预防保健、康复等为一体的三级甲等综合性医院。
新疆医科大学第六附属医院
崛起的新疆医科大学第六附属医院（新疆骨科医院），即原新疆建工医院始建于1957年，地处乌鲁木齐天山区五星路与红山路交汇处。历经几代人艰苦创业，开拓奋进，医院不断发展壮大，已成为集医疗、教学、科研、预防保健、社会（区）服务于一体、具有鲜明骨科特色的综合性二级甲等医院,现为新疆医科大学第六临床医学院。
新疆维吾尔自治区中医医院
新疆维吾尔自治区中医医院暨新疆医科大学附属中医医院、新疆中医药研究院及新疆中医名医名方研究开发中心，目前是中国西北地区规模最大的综合性三级甲等中医医院。
新疆医科大学第二附属医院
创建于1954年，经历了50多年风雨历程的新疆医科大学第二附属医院是一所集医疗、教学、科研、康复、预防为一体的省级综合医院，国家卫生部首批认定的“三级甲等”医院，自治区政府评定的“患者满意单位”和自治区级文明单位。
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乌鲁木齐经济技术开发区(头屯河区)第一人民医院
经济技术开发区（头屯河区）第一人民医院(原乌鲁木齐市头屯河区中心医院）是一所集预防、保健、医疗、教学、康复为一体的综合性二级甲等医院，编制床位数230张。隶属乌鲁木齐经济技术开发区（头屯河区）人民政府管理。
新疆医科大学第五附属医院
新疆医科大学第五临床医学院暨第五附属医院是一所集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的综合性三级甲等医院，位于乌鲁木齐市高新区（新市区）中心地带，占地面积约5万平方米，建筑面积约12万平方米，始建于1937年，是自治区首家命名的三级甲等综合医院。医院拥有20个自治区临床重点专科和1个全国综合医院中医药工作示范单位。2014年被健康报评选为“全国最具公信力三级甲等医院”。