新疆医科大学中医学院直属医院
新疆医科大学中医学院直属医院位于乌鲁木齐市鲤鱼山南路46号，始建于1992年，隶属于新疆医科大学管理的自收自支事业单位法人，经乌鲁木齐市卫生局批准设立的二级中医医院，编制床位99张。乌鲁木齐新市区银川路社区卫生服务中心设在该院，该院系国家中医特色社区卫生服务示范中心，是自治区和乌鲁木齐市城镇居民医疗保险定点医疗机构。
新疆维吾尔自治区人民医院
新疆维吾尔自治区人民医院始建于1934年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健和社区卫生服务为一体的大型综合性“三级甲等医院”。曾先后荣获“全国文明单位”、“全国百佳医院”、“全国五·一劳动奖状”、“全国卫生系统先进集体”、“全国万名医师支援农村卫生工程先进集体”、“全国十大百姓放心医院”、“全国卫生系统思想政治工作先进集体”、“自治区民族团结进步模范单位”等荣誉称号，是中国医院竞争力·顶级医院100强。
新疆维吾尔自治区儿童医院
北京儿童医院新疆医院前身为新疆交通医院，始建于1984年。2016年，自治区党委、政府整合区内优质儿科医疗资源，将我院规划建设为儿童专科医院，成立并挂牌“新疆维吾尔自治区儿童医院”。2019年，为贯彻落实党中央、国务院关于建设国家区域医疗中心的决策部署，自治区人民政府与首都医科大学附属北京儿童医院经友好协商签订合作协议，合作共建国家儿童区域医疗中心，北京儿童医院全面托管我院并挂牌“北京儿童医院新疆医院”、“国家儿童区域医疗中心”。在上级党委、政府的全面支持下，医院已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防保健
新疆生产建设兵团医院
新疆生产建设兵团医院正式成立于1982年，坐落于乌鲁木齐市青年路232号，目前已发展成为集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的省级综合性三级甲等医院。承担着兵团、自治区、乌市广大人民群众的医疗保健，担负着兵团及全疆疑难危重疾病的诊治和突发公共卫生事件的救治，是商业保险定点医院，自治区、兵团、乌市医保定点医院，同时也是自治区新农合医疗保险定点医院。实现了全疆异地联网结算。
新疆维吾尔自治区维吾尔医医院
新疆维吾尔自治区维吾尔医医院始建于1954年。1989年，经自治区人民政府批准，更名为“新疆维吾尔自治区维吾尔医医院”，隶属自治区卫生厅。现为一所集医疗、教学、科研为一体的综合性三级甲等维吾尔医医院。
乌鲁木齐市中医医院
乌鲁木齐市中医医院成立于1960年，经过几代中医人的努力，医院由小变大、由弱变强，现已发展成为集医疗、科研、教学、预防、保健、康复于一体的国家三级甲等中医医院，是新疆医科大学教学医院、乌鲁木齐地区中医适宜技术培训基地及自治区医保、兵团医保、兵团农十二师医保、铁路医保、乌鲁木齐市医保和所有商业保险定点医疗机构，一直保持“自治区级文明单位”的称号，连续多年获得医保、商保的先进集体。
乌鲁木齐米东区人民医院
米东区人民医院建院于1952年，医院占地面积17600平米，建筑面积46000平方米。目前是米东区规模最大，集医疗、预防、康复、保健为一体的二级甲等综合性医院，同时承担着米东区社区卫生服务中心公共卫生服务的一级服务体系。
乌鲁木齐国际医院
乌鲁木齐国际医院是市政府为建设“五大中心”对外开放平台，强化医疗服务中心合作功能，深化跨境远程医疗服务平台，跨境医疗旅游推介平台应用，打造具有国际服务水平的三级综合医院。国际医院位于乌鲁木齐市经济开发区莲湖路50号，距离乌鲁木齐高铁站约2公里，占地面积125亩，建筑总面积57000平方米。医院总床位数655张，学科建设齐全。医院于2019年8月16日正式开业。
新疆医科大学第一附属医院
新疆医科大学第一附属医院始建于1956年，是国家第一个五年计划中156个重点建设项目之一。建院59年来，经过几代人的不懈努力，已逐步发展成为一所集医疗、教学、科研、预防和管理为一体的大型综合性研究型医院，是自治区最大的“三级甲等综合医院”之一。
乌鲁木齐市友谊医院
乌鲁木齐市友谊医院（乌市第三人民医院）创建于1948年，迄今已有59年历史，59年来医院始终坚持“病人至上，质量第一”、“一切以病人为中心”的办院宗旨，把提高医疗质量、服务水平、人才培养、学科建设、科研创新放在医院优先发展的重要地位，不断加强与国内各大医院的联系与合作，使医院的综合实力得到了全面的提升，现已发展成为乌鲁木齐市唯一一所集医疗、预防、教学、科研、保健、康复为一体拥有四家分院的国家级三级甲等医院、国家级爱婴医院、卫生部“国际紧急救援中心”，“亚洲紧急救援中心”定点医院及新疆医科大学临床医学院、自
新疆生产建设兵团第六师奇台医院
新疆生产建设兵团第六师奇台医院位于天山东段博格达峰北麓、准噶尔盆地东南缘的古丝绸之路边陲古城奇台县。医院始建于1959年4月，是新疆生产建设兵团驻昌吉回族自治州东三县（奇台县、木垒县、吉木萨尔县）唯一一所规模大、设备全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、急救、预防、保健于一体的二级甲等医院。医院开放床位450张，设有临床、医技、职能等科室38个，现有职工430余名，中高级专业技术人员百余名。医院服务范围泽及农六师东线垦区六个农牧团场（社区）及昌吉州东三县，区域服务人口50余万人。
新疆军区总医院北京路临床部
新疆军区总医院北京路临床部是一所集医疗、教学、科研、康复、预防为一体的省级综合医院.